侯恂是河南商丘人氏，祖籍开封，字大真，号若谷，生于公元1590年，去世于公元1659年。侯恂在万历年间入朝为官，因为为官清正，多次遭到奸党陷害，仕途坎坷，是一位清正大员。

　　侯恂二十一岁的时候考中举人，万历二十六年三十一岁的时候考中进士，此后入朝为官。最开始的时候，授任守津县县令，后来官至太常寺卿。

　　天启二年，侯恂在邹元标的举荐下巡按桂州，在朝廷平定贵州水西土目安邦彦叛乱中立有功劳，解除贵州之围。事后论功行赏，准备将他提升为京卿，却遭到了以魏忠贤为首的阉党官员的阻止。

　　侯恂巡按贵州是由东林党重要成员邹元标举荐的，由此可见侯恂与阉党的关系并不要好。侯恂和他的父亲侯执蒲以及弟弟侯恪同朝为官，父子三人都清正廉洁。特别是父亲侯执蒲，以刚正不阿闻名朝野，因此自然要与阉党对上。

　　侯恂早些年在红丸案和移宫案之中，与魏忠贤奸党争锋相对，惹怒阉党。所以阉党一直将他们父子视为眼中钉肉中刺。恨不能除之而后快。于是在阉党官员的运作下，侯恂及其父亲和弟弟，相继被罢官。

　　崇祯年间，魏忠贤伏诛之后，侯恂才得以被重新起用，升任兵部侍郎。而后又因为在巡视边疆之时，遇黄花镇火灾，火箭火炮全部爆炸，因此受重伤，只能回家休养。

　　侯恂伤的十分严重，于是想要强求罢官。但是崇祯帝因为边疆事多，急需人才为由，并没有准许他的辞官，而是让他在家好好休养，养好身体继续为国家效力。

　　崇祯四年，侯恂代范文景的职位，到通州担任通州镇兵侍郎。当是时陕西起义军已经进入中原，户部侍郎周士朴上疏，请求往中原增派军队，并举荐侯恂统领左良玉的军队入怀庆和卫辉。

　　侯恂领兵之后，粮草紧急，多次上书请求发放粮饷，都遭到当权者的刁难。次年升任户部尚书，这个时候明朝的统治已经岌岌可危，内外交困，国库空虚。担任户部尚书之后，面临的却是“拮据兵饷，不事加派，而转运不乏”的情况。

　　侯恂在任期间兢兢业业，为人刚正不阿，又遭人嫉妒。特别是当时的阁臣薛国观和温体仁，对侯恂都看不惯，十分嫉妒，于是侯恂在魏忠贤阉党之后，又遭到排挤。

　　在薛国观和温体仁的唆使之下，侯恂被宋之普等人弹劾靡饷误国，于是被削职入狱。这一关，就关了七年。一直到崇祯十四年，才暂时从狱中出来。

　　崇祯十四年，老父侯执蒲去世，侯恂戴罪出狱，回家奔丧。第二年春天，又回到京师监狱。崇祯十五年，李自成领导的农民起义军席卷中原，而当时主要兵权又执掌在左良玉的手中。

　　左良玉为人骁悍，不服管教。而侯恂对他有提拔之恩，左良玉能有如此成就，多亏侯恂的慧眼识英雄。于是为了更好的节制左良玉，被关押的侯恂得到特赦，以兵部侍郎的身份，代替丁启睿总督保定等七镇军务，以解开封之围。

　　开封城陷落之后，侯恂再次被问罪罢官，于崇祯十六年被逮捕下狱。

　　崇祯十七年，明朝灭亡，崇祯帝自缢而亡。侯恂也在乱中被起义军从狱中放出来，在混乱中匿居南京，流落徽州。清顺治三年，回到商丘故里，建“侯府南园”，此后在此闲居到1659年去世。