明朝代元而兴，原有的回回人和回回工匠大都归附于明朝。于是原来在官营手工业作坊工作的工匠，大都成为个体工匠或转入其它行业。随着明代封建经济的发展及回回农业生产规模的扩大，一些具有回回民族特色的手工业也应运而生，并不断发展壮大。在回回民族中，具有重要影响的手工业生产主要是：1.制香业。制香业是和回回传统的香料贸易业相联系的。福建泉州蒲家，自元以来就一直从事制香行业。明初时因受迫害，逃亡永春、德化等地。但在到达永春、德化后，仍然继续经营制香业。如蒲氏14世孙蒲世茂在永春创置的香浦室，一直延续至解放以后。北京的“香儿李家”，其祖传制香业，据说也有数百年的历史。2.制革业。制革也是回回人的传统手工业，最初主要集中于西北河州和张家川两地。此后又逐步发展至河南省周口、朱仙镇、孟县桑坡，山东省济宁，甘肃省平凉等地。从业人数既多，技术力量也极雄厚。据说河南省的制革和皮毛生产，差不多全为回回人所垄断。而河南的制革，又以桑坡最有名。俗有“人知桑坡，而不知孟县”之说。3.制药业。回回医药，元代就已驰名遐迩。1270年(元至元七年)，元政府在大都就设有“广惠司”，专职“修制御用回回药物及和剂”，以为诸宿卫士治病。1292年(至元二十九年)，又设“回回药物院”“掌回回药事”，影响之大，不难窥其一斑。在陕西、山西和江浙一带，从元、明以来，民间还出现过不少靠卖药为生的人。如丁鹤年，一生颠沛流离，为谋生存，就“寄居僧舍，卖药以自给”。又如屯田于钧州的回回人，也有不少经营制药业的。据传云南孙继鲁家族，就是一个医药世家。其子创置的“万松草堂”药店，直到近代，还以秘制丸、散、膏丹闻名。北京王回回膏药、金回回膏药、马思远药锭，扬州夏子恒制作的明眼药、止咳饼、神功救急丸等，都名闻遐迩。常州沙氏，还因善泡制中药，在北京开设许多分店。此外，如洗染、制盐、制皂、磨面加工、铜锡、采矿等也有一定发展。